一流学科特指“世界一流学科”，与“世界一流大学”合称“双一流”。以下是所开设学科被评上“一流学科”的院校。需说明的是：一流大学均有一流学科，但是被评上一流学科的院校并不一定都是一流大学。
| 院校名称 | 学科层次 | 学科名称 |
|---|---|---|
| 北京大学 | 一级学科 | 生态学 |
| 中国农业大学 | 一级学科 | 农业资源与环境 |
| 中国农业大学 | 一级学科 | 植物保护 |
| 北京师范大学 | 一级学科 | 生态学 |
| 复旦大学 | 一级学科 | 生态学 |
| 华东师范大学 | 一级学科 | 生态学 |
| 南京农业大学 | 一级学科 | 农业资源与环境 |
| 浙江大学 | 一级学科 | 生态学 |
| 浙江大学 | 一级学科 | 园艺学 |
| 浙江大学 | 一级学科 | 植物保护 |
| 厦门大学 | 一级学科 | 生态学 |
| 华中农业大学 | 一级学科 | 园艺学 |
| 中山大学 | 一级学科 | 生态学 |
| 华南理工大学 | 一级学科 | 农学 |
| 贵州大学 | 一级学科 | 植物保护 |
| 云南大学 | 一级学科 | 生态学 |
| 西藏大学 | 一级学科 | 生态学 |
| 西北农林科技大学 | 一级学科 | 农学 |
| 兰州大学 | 一级学科 | 生态学 |
| 青海大学 | 一级学科 | 生态学 |
